Nach dem Einsatz der Psi-Ermitter auf der Welt Tarsonis durch Arcturus Mengsk, wandte sich Jim Raynor zusammen mit einigen Getreuen von Mengsk ab und gründete eine Widerstandsbewegung namens Raynor's Raiders. Sie kaperten Mengsks Flaggschiff, die Hyperion, und passten es an ihre eigenen Bedürfnisse an. Seitdem versuchen die Raiders Mengsks Imperium zu schaden, wann auch immer es möglich ist. Seit dem Ende der Brutkriege aus StarCraft 1 sind fast vier Jahre vergangen, in denen Raynors Leute der Terranischen Liga das Leben schwer machten, wo sie nur konnten.

Missionsübersicht
Raynor wird mehrere Missionen erhalten, die ihm von unterschiedlichen Personen vorgeschlagen werden. Je nach Art der Mission kann Raynor neue Streitkräfte gewinnen, wichtige Erkenntnisse über die Zerg oder Protoss erlangen oder schlichtweg die eigenen Finanzen etwas verbessern. Viele Missionen sind optional, bieten aber entscheidende Vorteile im Kampf gegen die Feinde Raynors.

• Mar Sara
  • Tag der Befreiung
    
  • Die Gesetzlosen
    
  • Die Stunde Null...
  
  
• Agria
  • Die Evakuierung
  
  
• Meinhoff
  • Epidemie
  
  
• Redstone III
  • Tanz auf dem Vulkan
  
  
• Monlyth
  • Wenn Zwei sich streiten...
  
  
• Tarsonis
  • Der große Zugraub
  
  
• Bel'Shir
  • Willkommen im Dschungel
  
  
• D-3974/Deadman's Rock, Hauptniederlassung Deadman's Port
  • Halsabschneider
  
  
• Valhalla, Umlaufbahn um Sigmaris Prime
  • Maschine der Zerstörung
  
  
• Neu-Folsom/Avernus Station, Umlaufbahn um Avernus
  • Ausbruch oder Ein Ghost für alle Fälle
  
  
• Haven
  • Ein sicherer Hafen oder Havens Untergang
  
  
• Korhal
  • Sondermeldung
  
  
• Castanar
  • Einblicke (Geheime Mission)
  
  
• Xil
  • Völlig Verbohrt
  
  
• Ulaan
  • Vorboten des Untergangs
  
  
• Zhakul
  • Eine dunkle Wende
  
  
• Aiur
  • Echos aus der Zukunft
  
  
• Shakuras
  • In ewiger Finsternis
  
  
• Tyrador VIII
  • Der Moebius-Faktor
  
  
• Typhon XI
  • Supernova
  
  
• Sigma-Quadrant
  • Schlund der Leere
  
  
• Char
  • Tore zur Hölle
    
  • Zwischen Himmel und Hölle oder In der Höhle des Löwen
    
  • Alles oder nichts
  
  Die Hyperion
  Das Flaggschiff von Raynor's Raiders besitzt mehrere Abteile, die der Spieler nutzen kann.
  So kann er in der Brücke neue Missionen annehmen und bereits abgeschlossene Missionen erneut spielen.
  Im Labor können erworbene Zerg- und Protossforschungspunkte für mächtige Upgrades ausgegeben werden. Gegen Bares lassen sich die Truppen mit Verbesserungen ausstatten und Söldner für zukünftige Missionen anheuern.
  • Kommandobrücke
    
  • Arsenal
    
  • Labor
    
  • Kantine